במסגרת הלימודים במכללה ירושלים, ניתן לשלב את לימודי התואר עם לימודים במדרשה, בתוך הקמפוס או מחוצה לו.
כחלק מהחיבורים בין קודש לחול, כל אחת מהלומדות במכללה ירושלים מוזמנת לבחור לימודי קודש בנתיב המתאים לה ולשאיפותיה.
הלימודים מתקיימים בשילוב המדרשות: צופיה (פסיפס דרכים בעבודת ה' "כשהנשמה מאירה"), אוריה (ברוח הרב קוק "תורה במרכז") ויעלה (בשלוחה של אילת במצפה רמון "להתרחק כדי להתקרב") והשיעורים נמסרים על ידי מיטב הרבנים והרבניות ממגוון הקשת הדתית בארץ.
במכללה מאמינים כי מחנכות מצטיינות, נשים מוצלחות ואימהות טובות, לא נהיות כאלו רק בעזרת תואר אקדמי ולכן מעודדים לצד לימודי התואר, להשקיע בבניין האישיות של הלומדות. הבן אדם קודם לבי איי -
(B.A - תואר ראשון) והמיסטר (בן הזוג) קודם למאסטר - ( M.A - תואר שני)
כך נהג להסביר לסטודנטיותיו הנמרצות נשיא ומייסד המכללה הרב ד"ר יהודה קופרמן זצ"ל.
ברוח זו מציעה המכללה לסטודנטיותיה מגוון מסלולים ללימוד תורה לשמה במהלך התואר, לבניין האמונה והמידות, לחקירה והתבוננות, למבוכה ולציפייה, לשאלות טובות ולעשיית חיל.
הבן אדם קודם לבי איי -
(B.A - תואר ראשון) והמיסטר (בן הזוג) קודם למאסטר - ( M.A - תואר שני)
תנ"ך - משולב
מחשבת ישראל - משולב
תנ"ך - מחשבת ישראל
הגיל הרך
אנגלית
חינוך מיוחד
מדעי הטבע
מוסיקה
מתמטיקה
משאבי למידה
מידע כללי
מדרשת צופיה
מדרשת אוריה
מדרשת יעלה
מדרשת מעיין שדרות
מידע ומסלולי השלוחה
ניהול וארגון מערכות חינוך
ייעוץ חינוכי
מדעי המחשב
